Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VhlP40338 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VhlP40338 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VhlP40338 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VhlP40338 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VhlP40338 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VhlP40338 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VhlP40338 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VhlP40338 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VhlP40338 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VhlP40338 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VhlP40338 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VhlP40338 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VhlP40338 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VhlP40338 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VhlP40338 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
VhlP40338 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VhlP40338 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
VhlP40338 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VhlP40338 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VhlP40338 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VhlP40338 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VhlP40338 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VhlP40338 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VhlP40338 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VhlP40338 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VhlP40338 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
VhlP40338 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VhlP40338 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
VhlP40338 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VhlP40338 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VhlP40338 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VhlP40338 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VhlP40338 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VhlP40338 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VhlP40338 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VhlP40338 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VhlP40338 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VhlP40338 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
VhlP40338 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
VhlP40338 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VhlP40338 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
VhlP40338 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VhlP40338 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VhlP40338 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VhlP40338 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VhlP40338 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VhlP40338 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VhlP40338 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VhlP40338 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
VhlP40338 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VhlP40338 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
VhlP40338 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
VhlP40338 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
VhlP40338 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
VhlP40338 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
VhlP40338 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
VhlP40338 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
VhlP40338 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
VhlP40338 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
VhlP40338 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
VhlP40338 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
VhlP40338 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VhlP40338 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VhlP40338 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VhlP40338 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
VhlP40338 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VhlP40338 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
VhlP40338 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
VhlP40338 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VhlP40338 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
VhlP40338 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VhlP40338 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VhlP40338 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VhlP40338 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
VhlP40338 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VhlP40338 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VhlP40338 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VhlP40338 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
VhlP40338 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VhlP40338 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VhlP40338 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
VhlP40338 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
VhlP40338 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VhlP40338 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VhlP40338 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VhlP40338 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VhlP40338 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VhlP40338 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VhlP40338 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VhlP40338 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VhlP40338 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VhlP40338 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VhlP40338 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VhlP40338 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
VhlP40338 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VhlP40338 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VhlP40338 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
VhlP40338 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
VhlP40338 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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