Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik2P39087 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik2P39087 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik2P39087 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik2P39087 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik2P39087 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grik2P39087 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms