Protein–RNA interactions for Protein: P39039

Mbl1, Mannose-binding protein A, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbl1P39039 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbl1P39039 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbl1P39039 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms