Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ddit3P35639 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms