Protein–RNA interactions for Protein: P35460

Ly6f, Lymphocyte antigen 6F, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6fP35460 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ly6fP35460 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ly6fP35460 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms