Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ly6dP35459 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ly6dP35459 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms