Protein–RNA interactions for Protein: P35441

Thbs1, Thrombospondin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs1P35441 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thbs1P35441 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thbs1P35441 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thbs1P35441 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thbs1P35441 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thbs1P35441 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thbs1P35441 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thbs1P35441 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thbs1P35441 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thbs1P35441 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thbs1P35441 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thbs1P35441 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Thbs1P35441 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Thbs1P35441 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Thbs1P35441 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Thbs1P35441 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Thbs1P35441 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Thbs1P35441 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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