Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mmp12P34960 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mmp12P34960 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms