Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nedd1P33215 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms