Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc11P31313 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms