Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ctnnd1P30999 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ctnnd1P30999 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms