Protein–RNA interactions for Protein: P30658

Cbx2, Chromobox protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx2P30658 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cbx2P30658 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cbx2P30658 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cbx2P30658 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cbx2P30658 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx2P30658 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx2P30658 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx2P30658 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx2P30658 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx2P30658 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx2P30658 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx2P30658 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx2P30658 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx2P30658 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx2P30658 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx2P30658 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cbx2P30658 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100 ms