Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VtnP29788 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VtnP29788 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VtnP29788 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VtnP29788 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VtnP29788 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VtnP29788 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VtnP29788 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VtnP29788 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VtnP29788 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VtnP29788 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VtnP29788 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VtnP29788 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VtnP29788 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VtnP29788 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VtnP29788 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VtnP29788 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VtnP29788 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VtnP29788 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VtnP29788 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VtnP29788 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VtnP29788 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VtnP29788 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VtnP29788 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VtnP29788 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VtnP29788 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VtnP29788 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VtnP29788 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VtnP29788 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VtnP29788 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VtnP29788 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VtnP29788 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VtnP29788 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VtnP29788 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VtnP29788 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VtnP29788 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VtnP29788 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VtnP29788 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VtnP29788 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VtnP29788 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VtnP29788 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VtnP29788 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VtnP29788 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VtnP29788 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VtnP29788 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
VtnP29788 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VtnP29788 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VtnP29788 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VtnP29788 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VtnP29788 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VtnP29788 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
VtnP29788 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VtnP29788 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VtnP29788 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VtnP29788 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VtnP29788 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VtnP29788 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VtnP29788 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VtnP29788 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VtnP29788 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VtnP29788 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VtnP29788 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VtnP29788 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VtnP29788 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VtnP29788 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VtnP29788 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VtnP29788 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VtnP29788 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VtnP29788 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VtnP29788 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VtnP29788 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VtnP29788 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VtnP29788 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VtnP29788 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VtnP29788 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VtnP29788 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VtnP29788 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VtnP29788 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VtnP29788 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VtnP29788 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VtnP29788 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VtnP29788 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VtnP29788 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VtnP29788 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VtnP29788 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VtnP29788 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VtnP29788 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VtnP29788 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VtnP29788 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VtnP29788 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VtnP29788 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VtnP29788 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VtnP29788 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VtnP29788 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VtnP29788 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VtnP29788 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VtnP29788 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VtnP29788 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VtnP29788 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VtnP29788 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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