Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprmP28828 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprmP28828 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprmP28828 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprmP28828 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprmP28828 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprmP28828 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PtprmP28828 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprmP28828 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprmP28828 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PtprmP28828 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
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