Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Hoxd10P28359 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Hoxd10P28359 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Hoxd10P28359 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Hoxd10P28359 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Hoxd10P28359 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Hoxd10P28359 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hoxd10P28359 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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