Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apex1P28352 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apex1P28352 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apex1P28352 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apex1P28352 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apex1P28352 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apex1P28352 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apex1P28352 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apex1P28352 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Apex1P28352 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms