Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CebpbP28033 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CebpbP28033 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CebpbP28033 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CebpbP28033 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CebpbP28033 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CebpbP28033 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CebpbP28033 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CebpbP28033 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CebpbP28033 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CebpbP28033 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CebpbP28033 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CebpbP28033 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CebpbP28033 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CebpbP28033 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CebpbP28033 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CebpbP28033 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CebpbP28033 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CebpbP28033 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CebpbP28033 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CebpbP28033 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CebpbP28033 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CebpbP28033 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CebpbP28033 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CebpbP28033 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CebpbP28033 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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