Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vav1P27870 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vav1P27870 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vav1P27870 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vav1P27870 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vav1P27870 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vav1P27870 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vav1P27870 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vav1P27870 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vav1P27870 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms