Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl3P27659 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl3P27659 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms