Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PdgfraP26618 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms