Protein–RNA interactions for Protein: P26043

Rdx, Radixin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RdxP26043 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RdxP26043 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RdxP26043 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RdxP26043 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RdxP26043 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RdxP26043 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RdxP26043 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RdxP26043 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RdxP26043 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RdxP26043 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RdxP26043 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RdxP26043 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RdxP26043 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RdxP26043 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RdxP26043 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RdxP26043 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RdxP26043 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RdxP26043 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RdxP26043 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RdxP26043 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RdxP26043 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RdxP26043 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RdxP26043 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RdxP26043 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RdxP26043 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RdxP26043 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RdxP26043 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RdxP26043 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RdxP26043 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RdxP26043 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RdxP26043 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RdxP26043 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RdxP26043 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RdxP26043 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RdxP26043 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RdxP26043 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RdxP26043 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RdxP26043 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RdxP26043 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RdxP26043 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RdxP26043 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RdxP26043 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RdxP26043 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RdxP26043 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RdxP26043 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RdxP26043 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RdxP26043 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RdxP26043 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RdxP26043 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RdxP26043 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RdxP26043 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RdxP26043 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RdxP26043 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RdxP26043 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RdxP26043 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RdxP26043 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RdxP26043 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RdxP26043 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
RdxP26043 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RdxP26043 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RdxP26043 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RdxP26043 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RdxP26043 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RdxP26043 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RdxP26043 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RdxP26043 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RdxP26043 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RdxP26043 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RdxP26043 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RdxP26043 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RdxP26043 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RdxP26043 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RdxP26043 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RdxP26043 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RdxP26043 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RdxP26043 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RdxP26043 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RdxP26043 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RdxP26043 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RdxP26043 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RdxP26043 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RdxP26043 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RdxP26043 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RdxP26043 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RdxP26043 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RdxP26043 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RdxP26043 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RdxP26043 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RdxP26043 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RdxP26043 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RdxP26043 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RdxP26043 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RdxP26043 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RdxP26043 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RdxP26043 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RdxP26043 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RdxP26043 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RdxP26043 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RdxP26043 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RdxP26043 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms