Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdk11bP24788 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdk11bP24788 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdk11bP24788 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms