Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd247P24161 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd247P24161 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd247P24161 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd247P24161 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd247P24161 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd247P24161 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd247P24161 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd247P24161 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd247P24161 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd247P24161 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd247P24161 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd247P24161 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms