Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms