Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hoxd8P23463 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms