Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PrkchP23298 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
PrkchP23298 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PrkchP23298 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkchP23298 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkchP23298 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkchP23298 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PrkchP23298 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkchP23298 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkchP23298 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkchP23298 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PrkchP23298 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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