Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PparaP23204 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PparaP23204 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PparaP23204 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PparaP23204 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PparaP23204 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PparaP23204 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PparaP23204 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PparaP23204 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PparaP23204 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PparaP23204 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PparaP23204 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PparaP23204 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PparaP23204 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PparaP23204 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PparaP23204 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PparaP23204 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PparaP23204 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PparaP23204 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PparaP23204 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PparaP23204 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PparaP23204 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PparaP23204 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PparaP23204 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PparaP23204 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PparaP23204 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PparaP23204 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PparaP23204 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PparaP23204 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PparaP23204 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PparaP23204 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PparaP23204 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PparaP23204 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PparaP23204 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PparaP23204 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PparaP23204 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PparaP23204 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PparaP23204 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PparaP23204 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PparaP23204 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PparaP23204 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PparaP23204 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PparaP23204 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PparaP23204 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PparaP23204 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PparaP23204 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PparaP23204 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PparaP23204 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PparaP23204 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PparaP23204 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PparaP23204 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PparaP23204 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PparaP23204 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PparaP23204 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PparaP23204 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PparaP23204 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PparaP23204 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PparaP23204 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PparaP23204 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PparaP23204 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PparaP23204 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PparaP23204 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PparaP23204 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PparaP23204 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PparaP23204 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PparaP23204 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PparaP23204 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PparaP23204 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PparaP23204 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PparaP23204 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PparaP23204 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PparaP23204 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PparaP23204 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PparaP23204 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PparaP23204 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PparaP23204 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PparaP23204 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PparaP23204 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PparaP23204 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PparaP23204 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PparaP23204 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PparaP23204 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PparaP23204 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PparaP23204 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PparaP23204 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PparaP23204 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PparaP23204 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PparaP23204 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PparaP23204 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PparaP23204 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PparaP23204 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PparaP23204 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PparaP23204 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PparaP23204 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PparaP23204 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PparaP23204 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PparaP23204 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PparaP23204 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PparaP23204 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PparaP23204 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms