Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tap1P21958 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tap1P21958 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tap1P21958 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tap1P21958 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tap1P21958 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tap1P21958 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tap1P21958 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tap1P21958 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tap1P21958 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tap1P21958 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tap1P21958 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms