Protein–RNA interactions for Protein: P21447

Abcb1a, Multidrug resistance protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1aP21447 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcb1aP21447 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Abcb1aP21447 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcb1aP21447 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcb1aP21447 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.03■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcb1aP21447 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Abcb1aP21447 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Abcb1aP21447 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Abcb1aP21447 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Abcb1aP21447 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Abcb1aP21447 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Abcb1aP21447 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Abcb1aP21447 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Abcb1aP21447 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Abcb1aP21447 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Abcb1aP21447 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Abcb1aP21447 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Abcb1aP21447 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Abcb1aP21447 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Abcb1aP21447 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Abcb1aP21447 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcb1aP21447 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcb1aP21447 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcb1aP21447 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcb1aP21447 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcb1aP21447 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcb1aP21447 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcb1aP21447 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcb1aP21447 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcb1aP21447 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcb1aP21447 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcb1aP21447 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcb1aP21447 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Abcb1aP21447 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms