Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PdgfaP20033 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms