Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lama1P19137 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lama1P19137 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lama1P19137 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Lama1P19137 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lama1P19137 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lama1P19137 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lama1P19137 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lama1P19137 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lama1P19137 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lama1P19137 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lama1P19137 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lama1P19137 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lama1P19137 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Lama1P19137 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Lama1P19137 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Lama1P19137 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lama1P19137 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lama1P19137 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lama1P19137 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lama1P19137 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lama1P19137 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lama1P19137 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lama1P19137 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lama1P19137 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lama1P19137 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lama1P19137 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lama1P19137 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lama1P19137 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lama1P19137 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Lama1P19137 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lama1P19137 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lama1P19137 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lama1P19137 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lama1P19137 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Lama1P19137 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lama1P19137 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lama1P19137 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lama1P19137 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lama1P19137 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Lama1P19137 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lama1P19137 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lama1P19137 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lama1P19137 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lama1P19137 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lama1P19137 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lama1P19137 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Lama1P19137 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lama1P19137 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Lama1P19137 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lama1P19137 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Lama1P19137 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lama1P19137 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lama1P19137 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lama1P19137 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lama1P19137 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lama1P19137 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lama1P19137 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Lama1P19137 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lama1P19137 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lama1P19137 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lama1P19137 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lama1P19137 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Lama1P19137 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lama1P19137 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lama1P19137 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lama1P19137 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lama1P19137 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lama1P19137 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lama1P19137 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lama1P19137 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lama1P19137 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lama1P19137 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lama1P19137 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lama1P19137 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lama1P19137 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lama1P19137 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lama1P19137 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lama1P19137 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lama1P19137 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lama1P19137 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lama1P19137 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lama1P19137 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Lama1P19137 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lama1P19137 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lama1P19137 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lama1P19137 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lama1P19137 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lama1P19137 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lama1P19137 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lama1P19137 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lama1P19137 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lama1P19137 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lama1P19137 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lama1P19137 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lama1P19137 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lama1P19137 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lama1P19137 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lama1P19137 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lama1P19137 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms