Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PcnaP17918 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PcnaP17918 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PcnaP17918 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PcnaP17918 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PcnaP17918 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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PcnaP17918 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PcnaP17918 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PcnaP17918 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PcnaP17918 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms