Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Defa-rs1P17533 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms