Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgfb3P17125 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms