Protein–RNA interactions for Protein: P16014

Chgb, Secretogranin-1, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgbP16014 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChgbP16014 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChgbP16014 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChgbP16014 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgbP16014 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgbP16014 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ChgbP16014 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgbP16014 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ChgbP16014 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms