Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rag1P15919 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rag1P15919 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rag1P15919 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rag1P15919 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rag1P15919 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rag1P15919 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms