Protein–RNA interactions for Protein: P15508

Sptb, Spectrin beta chain, erythrocytic, mousemouse

Predictions only

Length 2,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptbP15508 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SptbP15508 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SptbP15508 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SptbP15508 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SptbP15508 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SptbP15508 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SptbP15508 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SptbP15508 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SptbP15508 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SptbP15508 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SptbP15508 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SptbP15508 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SptbP15508 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SptbP15508 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SptbP15508 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SptbP15508 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SptbP15508 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SptbP15508 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SptbP15508 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SptbP15508 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SptbP15508 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SptbP15508 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SptbP15508 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SptbP15508 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SptbP15508 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SptbP15508 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SptbP15508 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SptbP15508 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SptbP15508 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SptbP15508 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SptbP15508 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SptbP15508 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SptbP15508 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SptbP15508 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SptbP15508 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SptbP15508 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SptbP15508 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SptbP15508 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SptbP15508 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SptbP15508 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SptbP15508 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SptbP15508 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SptbP15508 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SptbP15508 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SptbP15508 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SptbP15508 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SptbP15508 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SptbP15508 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SptbP15508 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SptbP15508 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SptbP15508 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SptbP15508 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SptbP15508 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SptbP15508 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SptbP15508 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SptbP15508 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SptbP15508 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SptbP15508 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SptbP15508 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SptbP15508 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SptbP15508 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SptbP15508 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SptbP15508 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SptbP15508 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SptbP15508 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SptbP15508 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SptbP15508 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SptbP15508 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SptbP15508 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SptbP15508 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SptbP15508 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SptbP15508 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SptbP15508 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SptbP15508 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SptbP15508 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SptbP15508 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SptbP15508 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SptbP15508 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SptbP15508 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SptbP15508 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SptbP15508 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SptbP15508 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SptbP15508 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SptbP15508 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SptbP15508 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SptbP15508 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SptbP15508 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SptbP15508 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SptbP15508 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SptbP15508 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SptbP15508 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SptbP15508 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SptbP15508 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SptbP15508 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SptbP15508 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SptbP15508 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SptbP15508 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SptbP15508 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SptbP15508 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SptbP15508 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms