Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf1P15314 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf1P15314 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf1P15314 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf1P15314 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf1P15314 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf1P15314 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf1P15314 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf1P15314 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Irf1P15314 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Irf1P15314 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf1P15314 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Irf1P15314 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Irf1P15314 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Irf1P15314 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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