Protein–RNA interactions for Protein: P12960

Cntn1, Contactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn1P12960 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cntn1P12960 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cntn1P12960 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cntn1P12960 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cntn1P12960 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn1P12960 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn1P12960 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn1P12960 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn1P12960 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn1P12960 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn1P12960 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn1P12960 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn1P12960 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn1P12960 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn1P12960 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn1P12960 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn1P12960 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cntn1P12960 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms