Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Calb1P12658 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Calb1P12658 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Calb1P12658 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Calb1P12658 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Calb1P12658 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Calb1P12658 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms