Protein–RNA interactions for Protein: P12032

Timp1, Metalloproteinase inhibitor 1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp1P12032 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timp1P12032 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timp1P12032 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timp1P12032 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timp1P12032 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timp1P12032 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timp1P12032 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timp1P12032 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Timp1P12032 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms