Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lamp1P11438 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms