Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PolP11369 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PolP11369 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PolP11369 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PolP11369 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PolP11369 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PolP11369 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PolP11369 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PolP11369 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PolP11369 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PolP11369 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PolP11369 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PolP11369 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PolP11369 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PolP11369 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PolP11369 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PolP11369 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PolP11369 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PolP11369 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PolP11369 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PolP11369 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PolP11369 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PolP11369 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PolP11369 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PolP11369 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PolP11369 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PolP11369 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PolP11369 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PolP11369 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PolP11369 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PolP11369 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PolP11369 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PolP11369 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PolP11369 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PolP11369 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PolP11369 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PolP11369 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PolP11369 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PolP11369 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PolP11369 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PolP11369 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PolP11369 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PolP11369 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PolP11369 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PolP11369 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PolP11369 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PolP11369 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PolP11369 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PolP11369 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PolP11369 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PolP11369 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PolP11369 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PolP11369 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PolP11369 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PolP11369 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PolP11369 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PolP11369 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PolP11369 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PolP11369 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PolP11369 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PolP11369 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PolP11369 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PolP11369 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PolP11369 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PolP11369 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PolP11369 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PolP11369 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PolP11369 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PolP11369 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PolP11369 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PolP11369 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PolP11369 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PolP11369 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PolP11369 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PolP11369 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PolP11369 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PolP11369 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PolP11369 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PolP11369 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PolP11369 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PolP11369 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PolP11369 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PolP11369 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PolP11369 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PolP11369 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PolP11369 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PolP11369 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PolP11369 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PolP11369 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PolP11369 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PolP11369 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PolP11369 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PolP11369 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PolP11369 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PolP11369 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PolP11369 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PolP11369 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PolP11369 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PolP11369 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PolP11369 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms