Protein–RNA interactions for Protein: P11260

Lire1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lire1P11260 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lire1P11260 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lire1P11260 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lire1P11260 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lire1P11260 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lire1P11260 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lire1P11260 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms