Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Hoxd4P10628 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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