Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms