Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CatspereP0DP43 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms