Protein–RNA interactions for Protein: P0DP28

Calm3, Calmodulin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm3P0DP28 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Calm3P0DP28 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms