Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Dnmt3cP0DOY1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms