Protein–RNA interactions for Protein: P0DN91

Tmem254c, Transmembrane protein 254c, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254cP0DN91 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem254cP0DN91 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem254cP0DN91 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem254cP0DN91 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem254cP0DN91 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem254cP0DN91 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem254cP0DN91 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem254cP0DN91 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem254cP0DN91 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem254cP0DN91 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem254cP0DN91 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem254cP0DN91 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem254cP0DN91 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tmem254cP0DN91 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tmem254cP0DN91 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms